Основано башкирами Минской волостиНогайской дороги на собственных землях, известно с 1664 года. Во второй половине XVIII века здесь учитывались ясачные татары. В середине XIX века принадлежало статскому советнику И. Ф. Базилевскому.
В 1865 в Нагаево (Петропавловском) в 115 дворах проживало 674 человека. Занимались земледелием, пчеловодством, изготовлением деревянных изделий. Были церковь, училище, конная мельница, располагалось волостное правление.
В 1906 году зафиксированы церковь, земская школа, фельдшерско-амбулаторный пункт, винная, пивная и три бакалейные лавки, хлебозапасный магазин; находилось волостное правление[4].
В 2007 году заложена церковь, освящена в 2009 году[10]. С открытием в 2008 году Пугачёвского моста через реку Уфу возле Каменной переправы территория стала активно застраиваться[11]. Около села находятся Нагаевские городища.
Гидрография
Два пруда. В юго-восточной части село имеет выход к реке Белой.
География
Расположено в юго-восточной части городского округа город Уфа, входит в состав Октябрьского района. Также имеет общие границы с Кировским и Калининским районами ГО город Уфа. Кроме того, граничит с Уфимским, Иглинским и Кармаскалинским районами Республики Башкортостан.
Территория Нагаево разделена на 40 кварталов, имеющих неофициальные цифровые обозначения[12]. Наряду с названием улиц это позволяет более точно идентифицировать расположение домов, особенно в процессе продолжающейся интенсивной застройки.
Село имеет автобусное сообщение с городом Уфой пригородными маршрутами № 124, 124к, № 278, 163 и 163д. 2023 С севера на юг пересечено Нагаевским шоссе — автомобильной дорогой Уфа — Охлебинино, что стало возможным после открытия в октябре 2008 года первой очереди Пугачёвского моста через реку Уфу. Расстояние до центра города Уфы по автодороге составляет 19 км.
Большая часть новых улиц в новостройках дороги не имеет никакого покрытия, только малая часть улиц обсыпана песком. Освещение присутствует только на центральной улице.
Образование
В селе Нагаево имеется детский сад № 37 (два корпуса), а также среднеобразовательная школа № 147. Первая очередь школы № 147[14] на 825 мест открыта 1 сентября 2017 года. Вторая очередь открыта 1 сентября 2018 года.