Родом из крестьянской семьи, католического вероисповедания. Отец — Юозас Кубилис, мать — Марийона Кубилене, урождённая Кубилюте[1]. В российских документах числится, как "крестьянин деревни Шендоля Ново-Александровского уезда Ковенской губернии"[2]. С 1892 по 1896 год учился в Елгавской гимназии. Там отказался молиться по православному обряду и был изгнан. Учился в Тельшевской духовной римско-католической семинарии, затем продолжил образование в Берлинском электротехническом институте. Начиная с 1894 года в Панямунелисе, распространитель книг на литовском языке, запрещенных русским правительством после польского восстания, как напечатанные «латинско-польскими буквами». В 1897 году создал в родном городе образовательный кружок "Žiburėlis". В нём тайно учили детей. В 1900 году поступил в семинарию в Каунасе. По сведениям российских источников, видимо, относящимся к каунасской семинарии "как раз перед выбором в Думу готовился к экзамену на аттестат зрелости "[2]. В 1900 году в Панямунельской волости создал тайную организацию "Звезда" (Žvaigždės). В 1905 году участник Великого Вильнюсского сейма. Конторщик Виленской "Литовской газеты".
26 марта 1906 избран в Государственную думу I созыва от общего состава выборщиков Ковенского губернского избирательного собрания. Входил в Трудовую группу, а также в Группу западных окраин. Член Комиссии по исследованию незакономерных действий должностных лиц. Подписал законопроект «О гражданском равенстве» и заявление об образовании Комиссии по расследованию преступлений должностных лиц.
10 июля 1906 года в г. Выборге подписал "Выборгское воззвание" и осужден по ст. 129, ч. 1, п. п. 51 и 3 Уголовного Уложения, приговорен к 3 месяцам тюрьмы и лишен избирательных прав.
В 1915—1917 годах сотрудничал с Литовским обществом помощи жертвам войны. Один из основателей партии национального возрождения в 1916 году. Сотрудничал с литовскими периодическими изданиями. Заболел туберкулёзом, был отправлен для лечения в Крым. Однако улучшение здоровья было недолгим[4]. Умер в Петрограде в 17 марта 1917 года. Был похоронен на кладбище в Выборге.
В 1929 году в Каунасе был посмертно опубликован сборник статей И. И. Кубилиса.
Семья
Сестра — Марцеле Кубилюте (Marcelė Kubiliūtė, 16 июля 1898—13 июня 1963)[1], сотрудница литовской разведки в Вильнюсском воеводстве, журналистка и общественная деятельница.
Брат — Йонас ("Янутис") Кубилис (?—1942, Краслаг)[1]
Российский государственный исторический архив. Фонд 1278. Опись 1 (1-й созыв). Дело 20. Лист 5; Фонд 1327. Опись 1. 1905 год. Дело 143. Лист 62 оборот.