Родился в 1390-х годах в селе Одноушево близ Солигалича в семье служилого землевладельца по имени Феодор Одноуш. «Иона бысть родом от места города Галича, близ предел казанския земли, разстояния имея от солигаличския яко 6 верст на реке на Святице, родися от отца благочестива, именем Феодора, зовомаго Одноуша, идеже ныне погост по его имени Одноушево именуемое, его же той Одноуш дал в дом соборной церкви Пречистыя, иже на Москве». В 12 лет принял монашескийпостриг в Благовещенском монастыре у погоста Унорож близ Галича[1]. Через несколько лет перешёл в Симонов монастырь (Москва), где исполнял послушание пекаря.
По смерти в 1431 году митрополита Фотия де-факто возглавил Русскую Церковь: в 1432 году он именуется «нареченным в Святейшую митрополию Русскую». Однако междоусобная борьба за великокняжеский престол не позволили святителю выехать в Константинополь к патриархуИосифу II для посвящения. Тем временем, осенью 1433 года литовский князь Свидригайло послал в Константинополь для посвящения в митрополита епископа СмоленскогоГерасима. Последний был возведён в Константинополе в сан митрополита всея Руси; но в 1435 году, заподозренный князем Свидригайло в измене, был умерщвлён. После кончины митрополита Герасима в Константинополь отправился епископ Иона; но, в 1437 году прибыв в столицу Империи, узнал, что патриарх Иосиф в 1436 году уже поставил на Русскую митрополию Исидора[3].
В 1458 году Москва отвергла предложение Литвы, привезённое Ивашенцем, о кандидатуре на пост митрополита Григория Болгарина, ученика митрополита Исидора.
Постоянно проживал в Москве и стал последним святителем, имевшим кафедру в Москве, но носившим титул митрополита Киевского.
В 1459 году соборным решением закрепил новый порядок избрания первосвятителей-митрополитов — Собором русских епископов с согласия московского князя. Таким образом, было положено начало фактической автокефалии Русской церкви, которая отвергла Флорентийскую унию.
Митрополит Иона имел большое влияние на великого князя Василия II, активно участвовал в его деятельности по объединению разрозненных русских княжеств.
При митрополите Ионе были торжественно причислены к лику святых Русской церкви местночтимые святые митрополит Алексий, мощи которого были обретены нетленными при перестройке Чудова монастыря, начатой в 1431 году, и Сергий Радонежский.
Скончался 31 марта 1461 года.
Мощи митрополита были объектом паломничества до 1812 года, пока не были выброшены французскими захватчиками после взятия Москвы[4].
Маясова Н. А. Древнейший покров митрополита Ионы // Государственный историко-культурный музей-заповедник «Московский Кремль». Материалы и исследования. — М., 1995. — Вып. 10: Древнерусское художественное шитьё. — С. 26-38
Макарий (Веретенников), архим.Чудотворец митрополит Иона // Митрополиты Древней Руси (X—XVI века). — М.: Изд-во Сретенского монастыря, 2016. — С. 671—735. — 1256 с. — 1000 экз. — ISBN 978-5-7533-1099-6.