Интегрин альфа-10

Интегрин альфа-10
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 2M32, 4A0Q
Идентификаторы
Псевдонимы	ITGA10, PRO827, integrin subunit alpha 10
Внешние ID	OMIM: 604042 MGI: 2153482 HomoloGene: 2697 GeneCards: ITGA10
Расположение гена (человек) Хр. 1-я хромосома человека[1] Локус 1q21.1 Начало 145,891,208 bp[1] Конец 145,910,111 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 3-я хромосома мыши[2] Локус 3|3 F2.1 Начало 96,552,900 bp[2] Конец 96,571,835 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в Descending thoracic aorta Наибольшая экспрессия в facial skeleton Dermatocranium fossa basisphenoid body of femur Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция связывание с ионом металла collagen binding involved in cell-matrix adhesion collagen binding Компонент клетки integrin complex клеточная мембрана мембрана integrin alpha10-beta1 complex часть мембраны Биологический процесс cell-matrix adhesion extracellular matrix organization агрегация клеток integrin-mediated signaling pathway Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 8515 213119 Ensembl ENSG00000143127 ENSMUSG00000090210 UniProt O75578 н/д RefSeq (мРНК) NM_001303040 NM_001303041 NM_003637 NM_001081053 NM_001302471 RefSeq (белок) NP_001289969 NP_001289970 NP_003628 н/д Локус (UCSC) Chr 1: 145.89 – 145.91 Mb Chr 3: 96.55 – 96.57 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Интегрин альфа-10 (α10) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA10, альфа-субъединица интегрина α10β1, рецептора для коллагена.

Функции

Интегрин альфа-10/бета-1 (α10β1) является рецептором для коллагена.^[5]

Структура

Интегрин альфа-10 — крупный белок, состоит из 1145 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 127,6 кДа. N-концевой участок (1100 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и небольшой внутриклеточный фрагмент (22 аминокислоты). Внеклеточный фрагмент включает 7 FG-GAP повторов, VWFA домен, до 11 участков N-гликозилирования. Цитозольный участок включает GFFKR мотив.

Интегрин альфа-10 относится к интегринам с I-доменом (VWFA домен), которые не подвергаются ограниченному протеолизу в процессе созревания. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 2 изоформ.

Тканевая специфичность

Интегрин α10β1 широко представлен в различных тканях, наиболее высокий уровень экспрессии — в мышцах и сердце. Присутствует также в суставных хрящах.

См. также

• Интегрины

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143127 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000090210 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Uniprot database entry for ITGA10 (accession number O75578)  (неопр.). Дата обращения: 7 марта 2012. Архивировано 16 февраля 2018 года.

Библиография

• Gullberg D.E., Lundgren-Akerlund E. Collagen-binding I domain integrins--what do they do? (англ.) // Prog Histochem Cytochem : journal. — 2002. — Vol. 37, no. 1. — P. 3—54. — PMID 11876085.
• Camper L., Hellman U., Lundgren-Akerlund E. Isolation, cloning, and sequence analysis of the integrin subunit alpha10, a beta1-associated collagen binding integrin expressed on chondrocytes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 32. — P. 20383—20389. — doi:10.1074/jbc.273.32.20383. — PMID 9685391.
• Bengtsson T., Camper L., Schneller M., Lundgren-Akerlund E. Characterization of the mouse integrin subunit alpha10 gene and comparison with its human homologue. Genomic structure, chromosomal localization and identification of splice variants (англ.) // Matrix Biol.^[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 20, no. 8. — P. 565—576. — doi:10.1016/S0945-053X(01)00164-0. — PMID 11731273.
• Brakebusch C., Hirsch E., Potocnik A., Fässler R. Genetic analysis of beta1 integrin function: confirmed, new and revised roles for a crucial family of cell adhesion molecules (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 1997. — Vol. 110, no. 23. — P. 2895—2904. — PMID 9359872.
• Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
• Lehnert K., Ni J., Leung E., et al. The integrin alpha10 subunit: expression pattern, partial gene structure, and chromosomal localization (англ.) // Cytogenetic and Genome Research^[англ.] : journal. — Karger Publishers^[англ.], 1999. — Vol. 87, no. 3—4. — P. 238—244. — doi:10.1159/000015434. — PMID 10702680.
• Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• Svoboda K.K. Chondrocyte-matrix attachment complexes mediate survival and differentiation (англ.) // Microsc. Res. Tech.^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 43, no. 2. — P. 111—122. — doi:10.1002/(SICI)1097-0029(19981015)43:2<111::AID-JEMT4>3.0.CO;2-O. — PMID 9822998.
• Bengtsson T., Aszodi A., Nicolae C., et al. Loss of alpha10beta1 integrin expression leads to moderate dysfunction of growth plate chondrocytes (англ.) // Journal of Cell Science^[англ.] : journal. — The Company of Biologists^[англ.], 2005. — Vol. 118, no. Pt 5. — P. 929—936. — doi:10.1242/jcs.01678. — PMID 15713743.
• Wenke A.K., Rothhammer T., Moser M., Bosserhoff A.K. Regulation of integrin alpha10 expression in chondrocytes by the transcription factors AP-2epsilon and Ets-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 2006. — Vol. 345, no. 1. — P. 495—501. — doi:10.1016/j.bbrc.2006.04.123. — PMID 16684505.

Ссылки

• Интегрины: введение