Время основания кафедры Падуи точно не определено. Предание связывает основание кафедры с именем святого Просдоцима (Просдокима), первого епископа Падуи, жившего в конце I века. Ранние свидетельства о существовании епархии Падуи относятся к началу IV века.
Первый собор в Падуе был построен в 313 году после «Эдикта Константина».
Гунны под предводительством Аттилы разрушили город, и епископы перенесли резиденцию в Маламокко. Только в VII веке при епископе Трицидии кафедра вернулась в Падую.
Во время землетрясения 3 января 1117 года разрушился старый собор. Здание было перестроено в романском стиле. Баптистерий был украшен фресками Джусто де Менабуои.
В 1551 году был одобрен проект нового собора работы Микеланджело Буонарроти, строительство которого длилось до 1754 года, но фасад так и остался не завершенным.
В 1671 году епископ Грегорио Барбариго основал епархиальную семинарию, при которой в 1684 году открыл типографию.
епископ Клаудио Чиполла (с 18 июля 2015 — по настоящее время).
Статистика
На конец 2004 года из 1 039 117 человек, проживающих на территории епархии, католиками являлись 1 027 662 человек, что соответствует 98,9 % от общего числа населения епархии.