Лотерея драфта была проведена 26 сентября2012 года, чтобы определить порядок выбора первой четвёрки команд предстоящего драфта, которая впервые в истории ВНБА транслировалась по телевидению на кабельном канале SportsCenter в 6:30 вечера по Североамериканскому восточному времени (EDT). Команда «Финикс Меркури» выиграла в ней право выбирать первой, в то время как «Чикаго Скай» и «Талса Шок» были удостоены второго и третьего выбора соответственно. Оставшиеся выборы первого раунда, а также все выборы второго и третьего раундов осуществлялись командами в обратном порядке их итогового положения в регулярном чемпионате прошедшего сезона.
В этой таблице представлены шансы четырёх худших команд прошлого сезона, не попавших в плей-офф, которые боролись за шанс получить первый номер выбора на лотерее предстоящего драфта, округлённые до трёх знаков после запятой:
2 февраля 2012 года команда «Миннесота Линкс» сначала подписала контракт с Алексис Хорнбакл, а затем продала её в «Финикс Меркури», получив взамен право выбора во втором раунде драфта.
19 февраля 2013 года «Вашингтон Мистикс» получил право выбора под 7-м и 19-м номером драфта в рамках сделки по продаже Жасмин Томас в «Атланта Дрим», которая помимо этого получила право выбора под 13-м номером драфта.
27 февраля 2013 года «Нью-Йорк Либерти» получил право выбора под 7-м номером драфта в рамках сделки по продаже Киа Вон в «Вашингтон Мистикс», который помимо этого получила право выбора под 17-м номером драфта.