Сандер Боскер начал свою футбольную карьеру в клубе «Лонга ’30», затем Сандер выступал за молодёжный состав клуба «Твенте». В 1989 году Боскер попал в основную команду «Твенте», его дебют состоялся 26 ноября 1989 года в матче против «Харлема», который завершился со счётом 2:2. Основным вратарём клуба Боскер стал лишь в 1993 году, и с тех пор Сандер оставался основным вратарём клуба вплоть до 2003 года, когда он перешёл в амстердамский «Аякс»[3][4], к этому времени Сандер провёл за «Твенте» 367 матчей и стал обладателем в 2001 году Кубка Нидерландов.
Став игроком «Аякса», Сандер за весь сезон 2003/04 так и не сыграл ни одного матча, «Аякс» в том сезоне стал чемпионом Нидерландов.
В 2004 году Боскер вернулся в «Твенте» и вновь стал первым вратарём клуба, годом позже в 2005 году Сандер подписал новый контракт с клубом до 2009 года. В 2006 году Сандер стал обладателем Кубка Интертото.
В июне 2012 года Сандер продлил контракт с «Твенте» до 2013 года[5].
1 июня 2010 года 39-летний Боскер дебютировал в составе сборной Нидерландов в товарищеском матче со сборной Ганы в Роттердаме (4:1), выйдя в перерыве на замену Мишелу Ворму. Боскер стал самым возрастным дебютантом сборной Нидерландов и одновременно самым возрастным футболистом, выступавшим за «оранжевых» за всю историю.
Боскер был включён в заявку сборной Нидерландов на чемпионат мира 2010 года в ЮАР, где стал вторым по возрасту футболистом после английского вратаря Дэвида Джеймса (род. 1 августа 1970).
