Биота (таксономия)

Биота
Научная классификация[1]
Наддомен: Биота
Международное научное название
Biota Cavalier-Smith, 1993
Синонимы
Somobialia Rafinesque, 1815 Zotica Spinola[2], 1850 Eobionti[3] Vitae[3]
Дочерние таксоны
См. текст
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе EOL   2913056 FW   28595

Био́та (лат. Biota) — термин, используемый в некоторых системах биологической классификации в качестве названия таксона, объединяющего все живые организмы Земли^[1]. Старшее научное название этого таксона — Somobialia (исходно во французском написании «l’Empire Somobial»)^[4]. В качестве таксономических синонимов термина Biota встречаются также названия Vitae («жизнь») и Eobionti^[3].

Ранг этого таксона иногда определяют как наддомен (гипердомен или супердомен).

Дочерние таксоны

Имеется несколько систем классификации живых организмов. Согласно одной из них, все живые организмы можно разделить на четыре группы^[1]:

• Aphanobionta Novák, 1930; группа без ранга, которая включает вирусы и вироиды;
• Archaea Woese, Kandler^[нем.] & Wheelis, 1990 — Археи; таксон в ранге домена;
• Bacteria (Haeckel, 1894) Woese, Kandler^[нем.] & Wheelis, 1990 — Бактерии; таксон в ранге домена;
• Eukaryota Whittaker & Margulis, 1978 — Эукариоты; таксон в ранге домена, объединяющий все живые организмы, клетки которых содержат ядра (в том числе растения, грибы и животные).

Устаревшая классификация:

• домен Эукариоты — организмы с ядром;
• домен Прокариоты — организмы без ядра;
• домен Вирусы — неклеточные организмы.

Филогения

Филогенез клеточных организмов и вирусов (включая сателлитные вирусы) был следующим в соответствии с исследованиями протеома^{[5][6][7][8][9][10]} . Вирусные клады будут представлять вымерших протобионтов из мира РНК и их переходов, что позволяет предположить существование предшествующих расхождению кладов в двух основных жизненных кладах. РНК и ретротранскрибированные вирусы были наиболее базальными, в то время как ДНК-вирусы были наиболее близкими к клеточным организмам, что согласуется с геномами ДНК, представленными клетками. Самой базовой кладой РНК-вирусов является тип Taraviricota, обнаруженный методом метагеномики, который включал бы некапсидные вирусы, подобные Endornaviridae или Mitoviridae, которые заражали бы прокариот с дефицитной клеточной стенкой и митохондрии эукариот.

Вироиды и вирусоиды не включались в анализы, поскольку в них отсутствует белок. Они также были бы более примитивными, чем вирусы и клеточные организмы. РНК-содержащие вирусы отмечены голубым цветом, вирусы с обратной транскриптазой — коричневым, а ДНК — бежевым.

Биота

Taraviricota         Arctoviricota             Cystoviridae       Pisuviricota           Reoviridae       Pomiviricota                 Ghabrivirales       Negarnaviricota             Sarthroviridae         Kitrinoviricota       Monodnaviria             Paraxenoviricota       Wamoviricota                 Lenarviricota       Pararnavirae           Tolecusatellitidae             Clavaviridae       Fuselloviridae           Adnaviria         Guttaviridae         Spiraviridae       Ampullaviridae                   Plasmaviridae       Globuloviridae           Duplodnaviria         Varidnaviria  (P)   Клеточные Бактерии   Patescibacteria (CPR)   Selabacteria/Eubacteria Terrabacteria   Thermobacteria (DST)         Cyanobacteria     Margulisbacteria           Actinobacteria     Firmicutes           Armatimonadetes     Eremiobacteraeota         Chloroflexi     Dormibacteraeota             Gracilicutes   Fusobacteria       Spirochaetes       Proteobacteria       Sphingobacteria (FCB)     Planctomycetes               Neomura   DPANN       Euryarchaeota   Proteoarchaeota   Crenarchaeota   Eukaryomorpha     Sifarchaeota         Jordarchaeota     Odinarchaeota           Baldrarchaeota     Thorarchaeota         Hermodarchaeota     Lokiarchaeota                 Wukongarchaeota     Heimdallarchaeota     Эукариоты Diphoda    Discoba   Diaphoretickes     Hemimastigophora       Provora       Haptista       Telonemia     SAR               Криптисты     Растения          Opimoda      Ancyromonadida       Malawimonadea     Metamonada       Podiata   Varisulca (CRuMs)    Униконты    Амёбозои   Obazoa   Breviatea       Apusomonadida   Заднежгутиковые   Holomycota   Cristidiscoidea     Грибы     Holozoa   Мезомицетозои       Pluriformea   Filozoa   Filasterea       Хоанофлагеллаты     Животные

Биота как термин в естествознании и экологии

Основная статья: Биота

Традиционно слова «биота» (от др.-греч. βιοτή — «жизнь») в естествознании использовалось как собирательный термин для обозначения исторически сложившейся совокупности растений и животных, распространённых на определённой территории^[11]. Другими словами, под биотой понимали флору и фауну — то есть всё, что подпадало под определение «живая природа». Более современное определение термина «биота», используемое в экологии, — исторически сложившаяся совокупность видов живых организмов (включая микроорганизмы), объединённых общей областью распространения в настоящее время или в прошедшие геологические эпохи.

Таксономический статус

Таксон Somobialia (= Biota) является голофилетическим (то есть монофилетическим в узком смысле слова), что доказывается наличием у него апоморфий — наличием единого генетического кода и клеточного строения. Некоторые авторы включают в биологическую систематику вирусы, вироиды, прионы и другие образования, и в соответствии с этим выделяют таксоны равного ранга Noncellulata (объединяющий вирусы) и Cellulata. Предполагают, что вирусы являются либо полифилетической группой, состоящей из вторично упростившихся паразитических Procaryota, либо происходят из фрагментов клеточных организмов. Во втором случае они вообще не могут быть объектом биологической систематики.

Таксон Somobialia (= Biota) включает все живые организмы на Земле. Некоторые авторы представляют себе жизнь как некое общее явление и определяют его перечнем тех или иных свойств; исходя из такого представления о живом, они высказывают предположения о возможности независимого возникновения жизни на других планетах. Однако если под живыми организмами понимать только представителей голофилетического таксона Somobialia (= Biota), обладающего определёнными аутапоморфиями, то его неоднократное возникновение представляется невозможным.

См. также

• Жизнь
• Neomura
• Система органического мира

Примечания

1. Таксон Biota в проекте The taxonomicon Архивная копия от 14 декабря 2009 на Wayback Machine (Дата обращения: 4 августа 2010)
2. Spinola, 1850.
3. Vitae (Biota, Eobionti) в международной энциклопедии BioLib Архивная копия от 2 августа 2010 на Wayback Machine (англ.) (Дата обращения: 4 августа 2010)
4. Rafinesque, 1815, p. 37.
5. Rijja Hussain Bokhari, Nooreen Amirjan, Hyeonsoo Jeong, Kyung Mo Kim, Gustavo Caetano-Anollés, Arshan Nasir (2020). Bacterial Origin and Reductive Evolution of the CPR Group Архивная копия от 25 августа 2023 на Wayback Machine. Oxford Academic. https://doi.org/10.1093/gbe/evaa024
6. Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25 de septiembre de 2015). "A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution". Science Advances. 1 (8): e1500527. Bibcode:2015SciA....1E0527N. doi:10.1126/sciadv.1500527. PMC 4643759. PMID 26601271.
7. Arshan Nasir, Kyung Mo Kim, Gustavo Caetano-Anolles (2012). Giant viruses coexisted with the cellular ancestors and represent a distinct supergroup along with superkingdoms Archaea, Bacteria and Eukarya Архивная копия от 25 ноября 2020 на Wayback Machine. BMC Evolutionary Biology.
8. Yates, Diana (25 сентября 2015). "Study adds to evidence that viruses are alive" (Press release). Champaign, IL: University of Illinois at Urbana–Champaign. Архивировано 19 ноября 2015. Дата обращения: 20 октября 2015.
9. Siddell, Stuart; Gorbalenya, Alexander E.; Krupovic, Mart; Varsani, Arvind; Kuhn, Jens H. Riboviria: establishing a single taxon that comprises RNA viruses at the basal rank of virus taxonomy (англ.) (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (15 октября 2018). Дата обращения: 9 марта 2019. Архивировано 28 октября 2021 года.
10. Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome Архивная копия от 6 октября 2022 на Wayback Machine. Science org.
11. Современный словарь иностранных слов: Ок. 20000 слов. — 4-е изд., стер.. — М.: Русский язык, 2001. — С. 98. — 742 с. — Доп. тираж 10 000 экз. — ISBN 5-200-02989-9. — УДК 811.161.1’373.45(038)

Ошибка в сносках^?: Тег <ref> с именем «taxonomicon», определённый в <references> в группе «», не имеет содержания.

Литература

• Rafinesque C.S. Analyse de la nature ou Tableau de l'univers et des corps organisés (фр.). — Palerme, 1815. — doi:10.5962/bhl.title.106607.
• Spinola M.M. Tavola sinottica dei generi spettanti alla classe degli insetti Artroidignati, Flemiptera. Linn. Latr. - Rhyngota, Fab. - Rhynchota, Burm. — Modena: Dai tipi della R.D. Camera, 1850..
• Cavalier-Smith T. Kingdom Protozoa and Its 18 Phyla // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 1993. — Т. 57 (4). — P. 953—994. — doi:10.1128/MMBR.57.4.953-994.1993..
• Кусакин О.Г., Дроздов А.Л. Филема органического мира. — СПб.: Наука, 1994. — Т. Часть 1. Пролегомены к построению филемы. — 272 с.
• Кусакин О.Г., Дроздов А.Л. Филема органического мира. — СПб.: Наука, 1997. — Т. Часть 2. Prokaryota, Eukaryota: Microspobiontes, Archemonadobiontes, Euglenobiontes, Myxobiontes, Rhodobiontes, Alveolates, Heterecontes. — 381 с.
• Клюге Н.Ю. Систематика насекомых и принципы кладоэндезиса. В 2 томах. — Москва: Товарищество научных изданий КМК, 2020. — 1037 с. — ISBN 978-5-907213-70-8.

Ссылки

• Systema Naturae 2000 / Classification: Biota Архивная копия от 22 декабря 2005 на Wayback Machine (Дата обращения: 4 августа 2010)