Схематическое изображение белковых молекул с субъединицами, выделенными различными цветами (красный и сине-зелёный; жёлтый — связывающий пептид).
Белковая субъединица в структурной биологии — полипептид, который вместе с другими компонентами собирается в мультимерный или олигомерныйбелковый комплекс. Многие природные ферменты и другие белки состоят из нескольких белковых субъединиц.
В некоторых белковых комплексах одна субъединица может называться «регуляторной», а другая «каталитической». Фермент, составленный из регуляторной и каталитической субъединиц, как и фермент, составленный из главной (неактивной, апофермент) и вспомогательной (активирующей, кофермент) субъединиц часто называется холоферментом. Одна белковая субъединица представлена одной молекулой полипептида, который кодируется самостоятельным геном, таким образом, в случае сложного белка, каждой субъединице соответствует отдельный ген, либо один ген соответствует нескольким идентичным субъединицам.
Субъединицы часто обозначают греческими или латинскими буквами, число субъединиц такого типа указывается в нижнем индексе. Например, фермент АТФ-синтаза имеет среди прочих субъединицы типа α. В одной молекуле фермента имеются три субъединицы α и обозначаются α3. Другие субъединицы обозначаются аналогичным образом, например, α3β3-гексамер — обозначение c-кольца АТФ-синтазы.
.svg){kind=small}
