До 1820 года ханство входило в состав Бухарского эмирата. В 1885 году присоединено к Афганистану.
В 1878 году полковник Н. И. Гродеков при поездке в Афганистан упоминал об Андхойском ханстве:
Н. И. Гродеков. 1883.
Что такое Афганский Туркестан? В состав его вошли следующие ханства: Маймене, Сарыпуль, Шибирхан, Акча, Андхой, Балх, Гурзиван, Дарзаб, Кундуз и Бадахшан. В настоящее время осталось полунезависимым только одно небольшое ханство Андхойское. Теперешнему хану Андхоя сохранены его владения за помощь и содействие, которые он оказал войскам Шир-Али-хана при покорении Меймене. Мир-Даулет-хан получает ежегодную пенсию из кабульской казны в размере 12.000 рупий (7.200 р.). В Андхое постоянно стоит полк афганской кавалерии, который имеет назначение защищать владения хана от набегов туркмен. Сам хан обязан ежегодно являться к тахтапульскому генерал-губернатору, в Мазар-и-Шериф, с подарками, которые идут в кабульскую казну. Во внутреннем управлении Мир-Даулет-хан действует самостоятельно и властен предавать смертной казни своих подданных. Таким образом Шир-Али-хан относительно этого деспота применил ту политику, какая практикуется англичанами в Индустане. Не имея законного предлога непосредственно присоединить к себе Андхой, он сделал Мир-Даулет-хана своим пенсионером и затем держит при нем войско, которое, под предлогом защиты ханства от туркмен, изображает из себя дамоклов меч, готовый опуститься, лишь только теперешний деспот станет неугодным эмиру.
Источники
Ариф Усманов, Некоторые сведения об узбеках Афганистана, Ташкент, 1975.