Родился в латышской семье. В 1919—1921 годах работал шофёром в Тамбовской ЧК.
В начале 1920-х годов сконструировал аэромотовагон — моторную дрезину с авиационным пропеллером (аэровагон). Потребляя незначительное количество горючего, вагон развивал высокую скорость. Цель Абаковского состояла в том, чтобы покрыть расстояние между отдалёнными городами России.
24 июля 1921 года Абаковский вместе с коллегой, видным российским государственным и политическим деятелем, Фёдором Сергеевым и другими пассажирами успешно испытали аэровагон на участке железной дороги Москва — Тула, однако на обратном пути в столицу вагон сошёл с рельсов. Абаковский и ещё пять человек из 21 пассажира, находившихся внутри вагона, погибли, ещё один скончался от травм позднее.