Martin Lister colaborou com numerosos artigos sobre história natural, medicina e arqueologia na revista da Royal Socieyy, "Philosophical Transactions". Seus principais trabalhos foram "Historiae animalium Angliae tres tractatus" (1678); "Historiae Conchyliorum" (1685-1692) e "Conchyliorum Bivalvium" (1696).
Em 1669, publicou numa tiragem muito limitada de "De Cochleis", onde apresentou numerosas espécies de conchas exóticas. Partindo do grande número de conchas que dispunha, começou então um vasto trabalho de ilustração de todas as espécies fósseis ou atuais que pode encontrar. Na primeira edição de "Historiae Conchyliorum" (1685-1692) milhares de espécies foram ilustradas, sem nenhum texto fora das curtas legendas. Nesta obra todas as espécies são facilmente reconhecíveis, com a indicação das localidades de procedência e não arranjadas aleatoriamente. As ilustrações das conchas foram organizadas em grandes grupos de acordo com o seu aspecto:
Uma cor
Raia preta
Ondulação transversal
Com uma banda
Manchado de preto
Manchado de branco
Nervuras transversais
Superfície granulosa
Abertura lisa ou não dentada
Sem espiral
Lister publicou, em Londres, três trabalhos sobre a anatomia dos moluscos: "Exercitatio anatomica…" (1694), "Exercitatio anatomica altera…" (1695) e "Conchyliorum bivalvium… exercitatio anatomica tertia…" (1699). Mostrou que a anatomia dos moluscos segue regras constantes. A intenção de Lister era juntar na sua obra "Historiae Conchyliorum" a descrição anatômica das "familles" que descrevia, porém não teve o tempo necessário para realizar o seu propósito.
As ilustrações de suas obras foram em grande parte assinadas por suas duas filhas, Susanna e Anna.
Como concologista foi levado em alta consideração, embora reconhecesse a semelhança dos fósseis de moluscos com os espécimes atuais, porém considerando-os como imitações inorgânicas produzidas nas rochas. Provavelmente foi o primeiro a estudar os moluscos cientificamente.
O interesse de Lister não ficou apenas no campo da história natural. Apresentou, em 1683, para a Royal Society uma proposta de um novo tipo de mapa geográfico que levaria em conta a natureza do solo, principalmente para revelar a presença de areias ou de argilas. Foi um dos primeiros a sublinhar a importância dos mapas geológicos. Em 1705, editou em Londres uma versão com anotações do tratado de Apicius.
Dr. Martin Lister: A bibliography by Geoffrey Keynes. (Inclui ilustrações da esposa e filha de Lister). Publicado pela St Paul's Bibliographies (Reino Unido) com um ISBN0-906795-04-4
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