O detentor do título Liverpool F.C. assim como 23 campeões nacionais dos países classificados em 27º ou pior no Ranking da UEFA 2004, foram sorteados e participaram em duas partidas, uma em casa e outra fora, tendo os vencedores avançado para a 2ª Pré-eliminatória. Apesar de ter terminado em 5º na FA Premier League em 2004-05 (apenas quatro equipas inglesas eram permitidas a participar), o Liverpool recebeu um lugar extra pela UEFA, pelo facto de serem os detentores do título.
Os 12 vencedores da 1ª Pré-eliminatória, os 10 campeões dos países classificados entre 17º e 26º, e os 6 segundos classificados dos países classificados entre 10º e 15º foram sorteados e participaram em dois jogos, em casa e fora, com os vencedores a avancarem para a 3ª Pré-eliminatória.
Os 14 vencedores da 2ª Pré-eliminatória, os 6 campeões dos países classificados entre 11º e 16º, os 3 segundos classificados dos países entre 7º e 9º, os 6 terceiros classificados dos países entre 1º e 6º, e os 3 quarto classificados dos países entre o 1º e 3º foram sorteados e participaram em dois jogos, em casa e fora, com os vencedores a avançarem para a fase de grupos e os derrotados a avançarem para a primeira ronda da Taça UEFA.
Os 16 vencedores da 3ª Pré-eliminatória, os 10 campeões dos países classificados entre 1º e 10º, e os 6 segundos classificados dos países entre 1º e 6º foram sorteados por 8 grupos de 4 equipas cada. As duas melhores equipas de cada grupo 2 avançam para os play-offs da Liga dos Campeões, enquanto as equipas terceiras classificadas avançam a 3ª Ronda da Taça UEFA.
Os factores de desempate são aplicados na seguinte ordem:
Os pontos ganhos nos jogos entre as equipas empatadas.
Número total de golos marcas nos jogos entre as equipas empatadas.
Número de golos marcados fora nos jogos entre as equipas empatadas.
Diferença de golos cumulativa em todos os jogos da fase de grupo.
Número total de golos marcados em todos os jogos da fase de grupo.
Nota: O esquema usado acima é usado somente para uma visualização melhor dos confrontos. Todos os confrontos desta fase são sorteados e não seguem a ordem mostrada.