Ele foi Cónego em Colónia antes de ser eleito Bispo de Utreque dadas as fortes pressões do seu primo direito, o imperador Maximiliano I. O imperador esperava que Frederico, sendo filho de uma princesa austríaca, favorecesse os interesses dos Habsburgos no bispado de Utreque.
Contudo, os estados de Utreque atuaram de forma independente e aproximaram-se de Carlos II, Duque de Gueldres. Frederico tentou atuar de forma firme, mas a luta de fações tornou-se excessiva para ele.
Em 1514, quando foi revelado que ele pretendia entregar o bispado ao candidato apoiado pelo rei Luís XII de França, ele perdeu o apoio do imperador Carlos V, que o forçou a resignar, em 9 de maio de 1517. Carlos V conseguiu, depois, que Filipe de Borgonha fosse eleito.
Após a sua morte, Frederico foi sepultado na igreja da Colegiada (Stiftskirche), em Baden-Baden.
Brasão de armas
Túmulo de Frederico de Baden com o seu escudo de armas
(em alemão) Heinrich Neu, Markgraf von Baden in Neue Deutsche Biographie (NDB);
(em alemão) Johann Christian Sachs, Einleitung in die Geschichte der Marggravschaft und des marggrävlichen altfürstlichen Hauses Baden, Vol. 2, Editora Lotter, Karlsruhe, 1767, Pág. 627–647, Livros Google
