BioJava

BioJava
Desenvolvedor	Andreas Prlić
Lançamento	Setembro 1999[1]
Versão estável	3.0.5
Escrito em	Java
Sistema operacional	Macintosh, Windows, Unix-like
Gênero(s)	Bioinformática
Licença	LGPL 2.1.
Página oficial	biojava.org

O projeto BioJava é um projeto de código aberto dedicado a fornecer ferramentas Java para o processamento de dados biológicos^[2]. Isto inclui objetos para a manipulação de seqüências, estruturas de proteínas, analisadores sintáticos de arquivo, CORBA interoperabilidade, DAS, acesso ao ACeDB, programação dinâmica, e rotinas de estatística.

A biblioteca BioJava é útil para automatizar muitos tarefas diárias e mundanas na área de bioinformática. A medida que a biblioteca amadurece, as bibliotecas BioJava tem fornecido uma base sobre a qual tanto o software livre quanto pacotes comerciais podem ser desenvolvidos. O projeto fornece kits de ferramentas com múltiplas funções que tornam mais fácil a criação de análises ou pipelines customizados^[1].

É um projeto de software ativo de código aberto apoiado pela Open Bioinformatics Foundation.

Ver também

• Open Bioinformatics Foundation
• BioPerl
• BioPython
• BioRuby
• Bioconductor

Referências

1. Mangalam, Harry (2002). «The Bio* toolkits--a brief overview». Brief Bioinform. 3 (3). p. 296-302. ISSN 1467-5463. PMID 12230038. doi:10.1093/bib/3.3.296 
2. Holland1, R. C. G.; Down2, T. A.; Pocock, M.; Prlić4, A.; Huen, D.; James, K.; Foisy, S.; Dräger, A.; Yates, A.; Heuer, M.; Schreiber, M. J. (2008). «BioJava: an open-source framework for bioinformatics». Bioinformatics. 24 (18). p. 2096-2097. doi:10.1093/bioinformatics/btn397  !CS1 manut: Nomes múltiplos: lista de autores (link)

Ligações externas

• Sítio oficial BioJava