Od 1 marca 1968 do 30 września 1970 zastępca naczelnika wydziału IV KW MO w Rzeszowie, od 1 października 1970 do 31 lipca 1974 jego naczelnik[3], od 19 listopada 1973 do czerwca 1976 był kierownikiem Samodzielnej Grupy „D” Departamentu IV MSW, zajmującej się dezintegracją kościoła katolickiego w Polsce, naczelnik Wydziału I Departamentu IV MSW (kierownicze ogniwa Kościoła katolickiego) od 1 lutego 1976 do kwietnia 1979, zastępca dyrektora Departamentu IV MSW od 20 kwietnia 1979 do 16 grudnia 1981, dyr. IV Departamentu MSW od 16 grudnia 1981 do 30 października 1984[4]. W 1983 mianowany generałem brygady[5].
Do dzisiaj niejasny pozostaje związek Zenona Płatka z zamachem na życie papieża Jana Pawła II. W kwietniu 1979 Płatek udał się do Wiednia, by odbyć spotkanie z prowadzonym przez siebie tajnym współpracownikiemSB ps. Tango w ramach ściśle tajnej operacji pod kryptonimem Triangolo. W tym samym czasie w Wiedniu przebywał turecki terrorysta Mehmet Ali Ağca.
2 listopada 1984 Płatek został zawieszony w obowiązkach służbowych w związku z zamordowaniem ks. Jerzego Popiełuszki. Mianowany rezydentem MSW, formalnie kierownikiem Grupy Operacyjnej Nr 5 „Praga” przy ambasadzie PRL w Pradze (1986–1990). W latach 1985–1989 pełnił funkcję zastępcy Dyrektora Departamentu V MSW[6]. W listopadzie 1989 został mianowany zastępcą Dyrektora Departamentu Ochrony Gospodarki MSW, pełnił tę funkcję do marca 1990[7]. W październiku 1990 aresztowany wraz z gen. Władysławem Ciastoniem i oskarżony o sprawstwo kierownicze zabójstwa ks. Jerzego Popiełuszki. Został przez sąd uniewinniony[8].
