Charakterystycznym basem Trujillo jest 5 strunowy Fernandes Gravity z niebieskimi płomieniami. Posiada również sygnowany model Sonus RT wykonany przez Zon Guitars. Zanim zaczął grać w Metallice, grał często na basach Tobias, ESP i Musicman (wszystkie pięciostrunowe) oraz Fender Precision Bass (grając z Ozzym Osbourne’em). Ostatnio widuje się go z pięciostrunowym basem Yamaha TRB5-P2, czterostrunowym Rickenbackerem 4001/4003, Fender Precision Bass, a także z Warwick Streamer. Dla efektu wah-wah Trujillo używa pedału Morley Wah Pedal, sygnowanego przez Marka Tremontiego.
Trujillo we współpracy z firmą Jim Dunlop stworzył swoją serię stalowych strun basowych (zakres grubości 45-130).
Controlled by Hatred/Feel Like Shit...Déjà Vu- 1989 [informacja błędną jest jakoby Trujillo brał udział w nagrywaniu tej płyty pod pseudonimem Stymee. Partie basu wykonywali tam zastępczo dwaj gitarzyści ST. określając tajemniczego basistę jako Stymee (ST why me). W czasie sesji nagraniowej tego albumu R. Trujillo nie było jeszcze w zespole choć występuje w teledyskach promujących ten album]