Rektora kościoła ustanawia i odwołuje ordynariusz, który poza opieką nad kościołem i sprawowaniem w nim funkcji liturgicznych może powierzyć rektorowi inne obowiązki duszpasterskie lub funkcje.
Bez zgody rektora w podległym mu kościele nie wolno sprawować funkcji liturgicznych. Rektor z kolei nie może wykonywać w swoim kościele funkcji należących do proboszcza (udzielać chrztów, asystować przy zawieraniu małżeństw, odprawiać pogrzebów), chyba że działa w porozumieniu i za zgodą proboszcza parafii, na której terenie znajduje się powierzony kościół.