Po wojnie w 1948 Stalin wykorzystał jego podróż po krajach kapitalistycznych jako element nagonki na swoich najbliższych współpracowników. Kazał go oskarżyć, że w czasie tego pobytu przesiąkł burżuazyjnądemokracją i imperializmem, w wyniku czego podjął współpracę z amerykańskimi tajnymi służbami. Icyk Fefer został zamordowany 12 sierpnia 1952 w podziemiach moskiewskiego więzienia na Łubiance.