Została utworzona na podstawie rozporządzenia Rady Ministrów dnia 21 lipca 1998 przy pomocy Fundacji Na Rzecz Gorzowskiej Szkoły Wyższej powstałej w 1994 r. Prezesem Fundacji był Kazimierz Marcinkiewicz, współzałożyciel i aktywny działacz uczelni, od 1998 Przewodniczący Konwentu. Po pierwszym roku istnienia społeczność akademicka uczelni wynosiła 1900 studentów i 200 słuchaczy kolegiów. Studenci mogli wybrać spośród sześciu specjalności: zarządzanie małym i średnim przedsiębiorstwem, administracja publiczna, edukacja wczesnoszkolna, edukacja opiekuńczo-wychowawcza, język polski i język niemiecki.
W 2006 r. uczelnia przejęła od Lubuskiego Urzędu Wojewódzkiego w Gorzowie Wielkopolskim zlokalizowany w miejscowości Rogi pałac dawnego Wojewódzkiego Ośrodka Doskonalenia Kadr Administracji Publicznej, tworząc w nim Ośrodek Naukowo-Dydaktyczny PWSZ.
W 2007 PWSZ przejęła od wygaszanego Nauczycielskiego Kolegium Języków Obcych kształcenie nauczycieli języka angielskiego, uruchamiając studia licencjackie w zakresie filologii angielskiej.
W 2009 nastąpiło połączenie uczelni z niepubliczną Wyższą Informatyczną Szkołą Zawodową. Zaowocowało to utworzeniem Instytutu Technicznego, prowadzącego kierunek informatyka oraz mechanika i budowa maszyn. Od tegoż roku szkoła prowadzi także studia drugiego stopnia w zakresie filologii polskiej, a rozwój pozostałych kierunków licencjackich i inżynierskich rokuje następne uprawnienia dydaktyczne w tym zakresie.
29 sierpnia 2013 r. Minister Nauki i Szkolnictwa Wyższego nadał uczelni nową nazwę, tj. Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa im. Jakuba z Paradyża w Gorzowie Wielkopolskim.
Władze uczelni przy wsparciu władz województwa podjęły działania mające na celu połączenie z Zamiejscowym Wydziałem Kultury Fizycznej poznańskiej AWF, w celu utworzenia Akademii Gorzowskiej[3].
W 2016 wszczęto procedurę powołania Akademii w Gorzowie, pomimo niespełniania wymogów formalnych dla przekształcenia w akademię[4]. Zgodnie z projektem ustawy przekształcenie nastąpiło z dniem 1 września 2016 r.[5]
W 2019 Akademia otrzymała (po raz pierwszy w historii jej istnienia) prawo do nadawania stopnia doktora, spełniając tym samym (zgodnie z ustawą Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce z dnia 20 lipca 2018 roku[6]) wymogi formalne dot. funkcjonowania uczelni akademickiej.
12 kwietnia 2024 w budynku Akademii przy ul. Teatralnej 25 wybuchł pożar dachu, w wyniku którego znaczna część zadaszenia oraz piętro pod nim zostały zniszczone[7][8].
W ofercie studiów szkoła proponuje również kształcenie podyplomowe, trwające 2, 3 lub 4 semestry, na kierunkach:
Bibliotekoznawstwo z informacją naukową
Finanse publiczne
Język polski dla nauczycieli
Logopedia
Pedagogika przedszkolna i wczesnoszkolna z terapią pedagogiczną dziecka
Pedagogika resocjalizacyjna
Przedsiębiorczość dla nauczycieli
Zarządzanie logistyką
Postępowanie egzekucyjne i windykacja
Bezpieczeństwo i higiena pracy
Język angielski dla nauczycieli przedszkoli
Ekonomia społeczna
Zarządzanie i ochrona informacji w administracji publicznej
Poradnictwo dietetyczne i prozdrowotne.
Uprawnienia do nadawania stopnia doktora i doktora habilitowanego
Akademia im. Jakuba z Paradyża w Gorzowie Wlkp. otrzymała prawo do nadawania stopnia doktora i doktora habilitowanego w dziedzinach:
inżynieria mechaniczna
językoznawstwo
pedagogika
Współpraca
Korzystne położenie geograficzne uczelni, na pograniczu polsko-niemieckim, w sąsiedztwie Berlina, w centrum Euroregionu „Pro Europa Viadrina”, w dużej odległości od takich ośrodków akademickich jak Poznań, Szczecin i Wrocław, doskonale uzupełniło i uzupełnia ofertę kształcenia w Polsce Zachodniej na poziomie wyższym. Wymiernym efektem działalności uczelni jest nawiązana i prowadzona na szeroką skalę współpraca międzynarodowa z zagranicznymi uczelniami, m.in.:
University Aldo Moro, Bari (Włochy)
University of Salerno (Włochy)
University of Macerata (Włochy)
Universite Paul Verlaine w Metz (Francja)
L’université Henri Poincaré w Nancy I (Francja)
Uniwersytecki Instytutu Kształcenia Nauczycieli w Lotaryngii (Francja)
Marchijski Instytut Wspierania Technologii i Innowacji w Strausbergu (Niemcy)
Pädagogische Hochschule w Wiedniu (Austria)
Hochschule w Cottbus (Niemcy)
Hochschule w Eberswalde (Niemcy)
Uniwersytet Utah, Salt Lake City; (USA)
Uniwersytet w Namur; (Belgia)
Uniwersytet Ostrawski, Ostrawa (Czechy)
Uniwersytet Śląski, Opawa (Czechy)
Szkoła Wyższa PRIGO, Hawierzów (Czechy)
W ramach współpracy krajowej uczelnia prowadzi wymianę studentów i pracowników naukowo-dydaktycznych, realizuje wspólne projekty badawcze, korzysta i udostępnia specjalistyczną bazę laboratoryjną oraz stwarza możliwość doktoryzowania i habilitacji pracowników uczelni na wydziałach uczelni partnerskich, np.:
Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
Uniwersytet Szczeciński w Szczecinie
Instytut Slawistyki Polskiej Akademii Nauk w Warszawie.
Ponadto uczelnia współpracuje ze szkołami średnimi oraz innymi instytucjami w Gorzowie i regionie, co stwarza dodatkowe możliwości uatrakcyjniania i wzbogacania oferty dydaktycznej uczelni w zakresie prowadzonych kierunków studiów.