Klub powstał w 2000 roku. Od roku 2003 gra na nowym stadionie (Městský fotbalový stadion) mogącym pomieścić 8121 osób.
W sezonie 2004/05 klub grał w finale Pucharu Czech, w którym uległ zespołowi Baník Ostrawa 1:2.
Z kolei w sezonie 2008/2009 zajął 10. miejsce w rozgrywkach 2.ligi. Jednak wykupił licencję od Zenitu Čáslav, który zajął premiowane 2. miejsce i od sezonu 2009/2010 zespół z Uherskego Hradišcia występuje w ekstraklasie.
W sezonie 2021/22 klub zdobył Puchar Czech, pokonując w finale Spartę Praga 3:1.
Historyczne nazwy
1927: SK Staré Město
1948: Jiskra Staré Město
1968: TJ Jiskra Staré Město
1993: SFK Staré Město
1994: FC Synot Staré Město
1999: FC Synot
2000: 1. FC Synot (powstały po połączeniu klubów: FC Synot oraz FC Slovácká Slavia Uherské Hradiště)
2004: 1. FC Slovácko
Europejskie puchary
Legenda do wszystkich tabel:
Q – runda eliminacyjna, 1/16, 1/8, 1/4, 1/2 – odpowiednia faza rozgrywek, Grupa – runda grupowa, 1r gr – pierwsza runda grupowa, 2r gr – druga runda grupowa, F – finał, R – runda, PO – play-off
k. – rzuty karne, los. – losowanie, Dogr. – dogrywka, w. – zasada bramek strzelonych na wyjeździe