Kirken nevnes skriftlig omtalt i et dokument fra synoden i Roma i 595.
Pavene Gregor III (731–741) og Leo III (795–816) lot den ombygge og utsmykke. På 1000-tallet tilkom et kloster tilsluttet kirken. På grunn av områdets usunne tilstand ble kirke og klosteret oppgitt på 1100-tallet; kirken forfalt. På 1200-tallet ble den overlatt til greske munker fra Santa Maria in Cosmedin. De befestet klosteret til vern mot invaderende barbarer og røvere som på denne tid streifet rundt på den romerske campagna.[3]
Under ledelse av kunsthistoriker og arkitekt Antonio Muñoz ble den restaurert årene 1927–1930. Muñoz' strategi innebar å gjenstille kirken til det utseende han trodde at den hadde hatt i middelalderenb; han hadde imidlertid sjelden arkeologiske bevis for sine meninger. Senere tillegg, som under barokken, behandlet han med forakt. I Santa Balbina lot Muñoz blant annet gjenåpne vinduer som var blitt murt igjen eller forminsket; de tre vinduer i ble også foresett med transennae, det vil si en slags perforert skjerm i stein eller marmor.[4] I følget Ferruccio Lombardi ødela Muñoz flere kunsthistorisk verdifulle arkitektoniske elementer.[3]
Tredje sidekapell til venstre er viet Vår Frue av Fátima. Kapellet hyser blant annet en 1200-tallsfreske forestillende Kristus og Jomfru Maria med fire apostler, attribuert til Pietro Cavallinis skole.
Cappella di Sant'Antonio di Padova
Femte sidekapell er viet den hellige Antonius av Padova og har en moderne statue av ham.
På fasadens innervegg er Stefano de Surdis gravmonument, et cosmatarbeid fra 1303.[5][6]
^«S. Balbina». The Cardinals of the Holy Roman Church (på engelska). Salvador Miranda. Arkivert fra originalen 12. januar 2020. Besøkt 12. januar 2020.
Litteratur
Le chiese di Roma dal secolo IV al XIX (på italiensk). Roma: Edizioni del Pasquino. 1982. s. 590–591.
Le chiese di Roma dal secolo IV al XIX (på italiensk). Roma: Edizioni R.O.R.E. di N. Ruffolo. 1942. s. 1260.
Roma (på italiensk). Milano: Touring Club Italiano. 2002. s. 508–509. ISBN88-365-2541-5.
Le chiese di Roma nel medio evo (på italiensk). Firenze: Leo S. Olschki. 1927. s. 203–204.
Roma: chiese, conventi, chiostri: progetto per un inventario 313—1925 (på italiensk). Roma: Edilstampa. 1993. s. 368.
Restauro a Roma 1870–2000: architettura e città (på italiensk). Venezia: Marsilio Editori. 2000. ISBN88-317-7334-8.
Guida insolita ai misteri, ai segreti, alle leggende e alle curiosità delle Chiese di Roma (på italiensk). Roma: Newton & Compton. 2000. s. 42. ISBN88-8289-419-3.