Michael D. Pfeifer var sønn av Maund Pfeifer og Alice Clausney Savage. Han vokste opp på en familiegård, og opplevde perioder med fattigdom. Pfeifer begynte på St. Anthony's Junior Seminary i en alder av 13 år.
Han avla sine første løfter hos oblatfedrene den 31. mai 1958[1]
Prest
Den 21. desember 1964 ble Pfeifer ordinert til prest av biskop Stephen Leven. Etter sin ordinasjon virket Pfeifer som misjonær i Mexico i flere år.[1]
Pfeifer har talt mot medisinsk forskning som bruker embryonale stamceller i stedet for voksne stamceller.[3][4]
Den 17. desember 2008 ble Pfeifer og bispedømmet San Angelo saksøkt av en San Angelo-mann. Saksøkeren hevdet at David Espitia, pastor i St. Ann's Parish i Colorado City i Texas hadde misbrukt ham seksuelt fra 1994, da han var åtte år gammel, til 2002, og at bispedømmet hadde dekket over forbrytelsene. Som svar sa Pfeifer at Espita fortalte ham 13. juni 2003 om påstandene og benektet dem alle. På det tidspunktet satte Pfeifer i gang en etterforskning. En uke etter møtet med Pfeifer begikk Espita selvmord.[5][6][7] Den 21. november 2011 inngikk bispedømmet et utenforrettslig forlik med saksøkeren.[8]
Pennsylvania Grand Jury Report 2018 om seksuelle overgrep fra geistlige skildret en del om overføringen av Thomas C. Kelley, en prest fra bispedømmet Erie i Pennsylvania, til bispedømmet San Angelo, til tross for sendende biskop kjennskap om påstander om seksuelle overgrep mot unge menn. Fem menn i alderen 28 til 25 anklaget Kelley for seksuelle tilnærmelser enten på en videregående skole eller i seminaret; en mann mottok et økonomisk oppgjør fra bispedømmet Erie. Kelley ble sendt til psykologisk behandling to ganger; begge fasilitetene løslot ham med anbefalinger om at de ikke har kontakt med unge sognebarn.
I 1995 ba Kelley om en overføring til bispedømmet San Angelo. Pfeifer hadde en samtale i 1995 med Erie-biskop Donald Trautman der de diskuterte saken. Pfeiffer gikk til slutt med på Kelleys overføring uten noen tjenstlige begrensninger. Det kom ingen anklager om overgrep mot Kelley i løpet av hans ti år i bispedømmet San Angelo; han døde i 2005. Pfeifer har nektet å kommentere historien. (Biskop Michael Sis av San Angelo, etterfølgende biskop Pfeifer i 2013, sa at saken gjorde ham såret og sint.[9])
Pensjonering
Pfeifer sendte inn sitt avskjedsbrev som biskop av San Angelo til pave Benedikt XVI på sin 75-årsdag 18. mai 2012.[10]Pave Frans innvilget Pfeifers fratreden den 12. desember 2013.