Antanas Vaičius kom from en bondefamilie og hadde fire søstre og én bror. Antanas Vaičius hadde skolegang fra 1934 til 1943 ved skoler i Šačiai, Mosėdis, og ved gymnasiet i Skuodas.
Han studerte fra 1943 til 1946 ved presteseminaret i Telšiai. Da ble det stengt av de nye sovjetiske makthavere. Han fortsatte da fra 1946 til 1951 ved presteseminaret i Kaunas.[1]
Prest
Han ble presteviet den 24. september 1950 av biskop Kazimieras Paltarokas. Han innehadde så forskjellige oppgaver i bispedømmet Telšiai og i prelaturet Klaipėda. Fra 1965 til 1973 var han sogneprest i Akmenė og stedfortredende dekan i Viekšniai. Fra 1973 til 1975 var han sogneprest i Telšiai og bispedømmetskansellist. I 1975 ble han kapitularvikar for bispedømmet Telšiai og prelaturet Klaipėda.
I 1987 fikk biskop Antanas Vaičius som den eneste litauiske prelat tillatelse fra de sovjetiske myndigheter til å reise til Roma der han den 28. juni deltok i den høytidelige feiring av «Litauens dåp», og ved saligkåringen av erkebiskop Jurgis Matulaitis.
Biskop av Telšiai
Den 10. mars 1989 ble han ordinarie biskop av Telšiai. Fra 1988 til 1993 var han viseformann for Den litauiske bispekonferanse.
Hans aldersbetingede anskjedssøknad ble innvilget av pave Johannes Paul II den 26. mai 2001.