Troms er og har vært delt inn i en rekke ulike områder til å administrere ulike funksjoner. Fylket utgjorde tidligere et fogderi med navnet Senjen og Tromsø fogderi, og tilhører i dag Helse Tromsø helsedistrikt under Helseregion Nord-Norge. I øvrige administrative sammenhenger er kommunene i fylket inndelt på følgende måte: