Racing de Santander werd opgericht op 14 juni1913. In 1914 kreeg de club het predicaat Real (Koninklijk). In totaal speelde Racing 37 seizoenen in de Primera División en 32 in de Segunda A. Vijf jaargangen werden verder in lagere divisies doorgebracht, waarvan één in de Segunda División B en vier in de Tercera División. Vrijwel ieder seizoen dat Racing uitkomt in de Primera División strijdt de club tegen degradatie, soms met succes en soms niet. Zo degradeerde de club in 2001 naar de Segunda División A, maar een jaar later keerde Racing de Santander terug op het hoogste niveau. In het seizoen 2007/2008 plaatste Racing zich voor het eerst voor de UEFA Cup. Het team bestond destijds uit onder meer routiniers Pedro Munitis en Nikola Žigić en diverse talenten zoals Ezequiel Garay en Sergio Canales, die later beide naar Real Madrid zouden vertrekken. Na deze succesvolle periode werden de resultaten minder en Racing degradeerde in de zomer van 2012 naar de Segunda División A. In de zomer van 2013 degradeerde Racing wederom, dit keer naar de Segunda División B.
Begin 2014 werd een volgend dieptepunt bereikt want de return in de kwartfinales van de Spaanse beker tussen Racing de Santander en Real Sociedad duurde slechts luttele seconden. De spelers van Racing weigerden namelijk verder te spelen en gingen zij aan zij bij de middencirkel staan, waarna de scheidsrechter besloot de wedstrijd te staken. De selectie en de technische staf hadden er in de aanloop naar het duel al mee gedreigd als de voltallige directie niet zou opstappen. Dit uit ontevredenheid over het al maanden uitblijven van salaris. Deze actie kwam Santander duur te staan want de RFEF besloot de ploeg voor jaargang 2014/15 te weren uit het bekertoernooi, daarnaast moest de club een boete van 3.006 euro betalen.
Het zou duren tot juni 2019 om weer eens een positief evenement mee te maken. Nadat de club de reguliere competitie als kampioen van groep 2 had afgesloten, werd in de play-off Club Deportivo Atlético Baleares verslagen. Zo speelde de ploeg vanaf seizoen 2019/2020 weer in de Segunda División A. Het succes zou van korte duur zijn, aangezien heel het seizoen de ploeg aan de staart bengelde en na 38 wedstrijden van de 42 was de degradatie al een feit. Seizoen 2020/2021 is er weer een in de Segunda División B. Tijdens dit overgangsseizoen, de laatste maal dat de Segunda B georganiseerd werd, kon de ploeg een plaats afdwingen in het nieuwe derde niveau van het Spaans voetbal, Primera División RFEF. De ploeg werd in groep 1 ingedeeld en speelde tijdens het seizoen 2021/2022 onmiddellijk kampioen.[1] Ook de eretitel van algemeen kampioen werd behaald na een 3-0 overwinning tegen de kampioen van de andere groep, FC Andorra. Zo speelt de ploeg vanaf seizoen 2022/2023 weer in de Segunda División A.
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
