Flynt heeft zich meerdere keren politiek geprofileerd; zo was hij in 1984 korte tijd Republikeinspresidentskandidaat waarin hij het opnam tegen zittend president Ronald Reagan. Deze partijkeuze was uitzonderlijk omdat hij eigenlijk Democraat is.
Op 6 maart 1978 werd hij door Joseph Paul Franklin onder vuur genomen. Als gevolg daarvan raakte hij vanaf zijn middel verlamd; sindsdien was hij aangewezen op een rolstoel. Hij had bovendien aanhoudend ernstige pijn en raakte verslaafd aan pijnstillers totdat de aangedane zenuwen middels een aantal operaties uitgeschakeld werden. Franklin verklaarde later dat hij Flynt wilde ombrengen omdat hij uiterst verontwaardigd was over een fotoserie met interraciale seks in Flynts tijdschrift Hustler. Flynt was manisch-depressief.
Flynt was in totaal vijf keer getrouwd, de langste periode met Althea Flynt die later aids kreeg en in 1987 in een badkuip verdronk (waarschijnlijk door een overdosisheroïne).
Zijn oudste dochter Tonya Flynt-Vega werd door hem onterfd omdat ze een christelijke activiste tegen pornografie werd.
Zijn leven is verfilmd in de film The People vs. Larry Flynt uit 1996 waarin de Amerikaanse acteur Woody Harrelson Larry Flynt speelt. Flynt speelt in deze film zelf een bijrol als rechter. Critici menen dat de film een rooskleurig en niet zo waarheidsgetrouw beeld van hem geeft.
