In 2003 werd het 61ste Campeonato Mato-Grossense gespeeld voor voetbalclubs uit de Braziliaanse staat Mato Grosso. De competitie werd georganiseerd door de FMF en werd gespeeld van 8 februari tot 25 mei. Cuiabá werd kampioen.
CE Operário Várzea-Grandense werd na het vorige seizoen ontbonden. EC Operário werd opgericht om de club op te volgen, in 2005 nam deze club de naam Operário FC aan.
De drie winnaars en de beste verliezer plaatsen zich voor de volgende fase.
In geval van gelijkspel gaat de club met het beste resultaat in de competitie door.