België was, net als bij het Eurovisiesongfestival, een van de stichtende leden van de juniorvariant. In 2003 mocht de VRT als eerste een kandidaat kiezen. X!NK won Eurosong for Kids 2003 en mocht met De vriendschapsband voor het land naar het eerste festival, in de Deense hoofdstad Kopenhagen. Daar behaalde de groep de zesde plaats, met 83 punten. België kreeg punten van elk land.
In 2005 werd het Junior Eurovisiesongfestival in Hasselt georganiseerd, in een coproductie van RTBF en VRT. België won het recht om het festival te organiseren van Kroatië en Nederland. De preselectie werd, mede omdat het festival in eigen land plaats zou vinden, georganiseerd door de twee omroepen samen. Uiteindelijk won LindsayEurokids 2005 en mocht zij met Mes rêves naar Hasselt. Op het grote festival werd ze uiteindelijk tiende, met 63 punten.
Wegens de te lage kijkcijfers besliste de RTBF na het festival van 2005 om niet meer deel te nemen. België werd vanaf dat moment enkel nog door de VRT vertegenwoordigd. In Boekarest, de hoofdstad van Roemenië, mocht Thor! het land vertegenwoordigen. De jongste deelnemer van 2006 eindigde met Een tocht door het donker op de zevende plaats, met 71 punten. Ook op dit festival kreeg België punten van alle landen.
In 2007 werd Trust werd met het lied Anders naar Rotterdam gestuurd. Hoewel getipt als outsiders voor de overwinning, kreeg de groep enkel punten van Nederland. Met 19 punten, waarvan 12 bij de start gegeven, werden ze 15de. Het was de eerste keer in de geschiedenis van het Junior Eurovisiesongfestival dat België buiten de top tien viel.
In 2008 nam België opnieuw deel aan het Junior Eurovisiesongfestival, dat jaar in Limasol. Het land werd vertegenwoordigd door Oliver met het lied Shut up. Hij belandde net buiten de top tien, met 45 punten, één minder dan gastland Cyprus.
Ook in 2009 nam het land deel. Na een preselectie waarin elke kandidaat zijn nummer in twee versies mocht zingen, werd uiteindelijk gekozen voor Laura, met haar nummer Zo verliefd (yodelo). In Kiev, Oekraïne werd ze vierde met 113 punten. Voor de derde keer in zeven jaar tijd kreeg België van elk land punten. Het land haalde ook het meeste aantal twaalf punten van alle deelnemers. Vanuit Macedonië, Malta, Nederland en Servië kwamen er twaalf punten richting België.
België nam ook in 2010 deel aan het festival. Tijdens de talentenjacht Junior Eurosong 2010 werd een geschikte kandidaat gezocht om het land te vertegenwoordigen in Minsk. Uiteindelijk wonnen Jill & Lauren met het nummer Get up!. Het was het eerste duo dat België naar het Junior Eurovisiesongfestival stuurde. In Minsk werden de meiden uiteindelijk zevende.
In 2012 nam België voor de tiende keer deel aan het Junior Eurovisiesongfestival. Het was daarmee, samen met Nederland en Wit-Rusland, een van de drie landen die aan alle edities tot dan toe had deelgenomen. Fabian won Junior Eurosong met het nummer Abracadabra, en mocht aldus België vertegenwoordigen in Amsterdam, Nederland. Daar eindigde hij op de vijfde plaats, de tweede beste Belgische prestatie uit de geschiedenis van het festival.
In 2013 besloot de VRT vanaf dat jaar niet langer mee te doen aan het Junior Eurovisiesongfestival vanwege de beperkte interesse ervoor bij het publiek en de deelnemers zelf. Het preselectieprogramma Junior Eurosong werd vervangen door een andere muzikale talentenjacht, Wie wordt Junior?, maar de winnaar daarvan zou niet meer naar het internationale evenement worden afgevaardigd.[1]
Net zoals het Eurovisiesongfestival werd het Junior Eurovisiesongfestival in de eerste jaren elk jaar uitgezonden door zowel de RTBF als de VRT. Vanaf de terugtrekking van de RTBF in 2006, zond enkel de VRT het festival nog uit. De commentatoren van dienst waren: