Pengendali kereta api Singapura ialah SMRT Trains Limited, anak syarikat milik penuh SMRT Corporation. Ia pada mulanya dinamakan Singapore MRT Limited selepas MRT disewa pada tahun 1995. Ia dinamakan semula sebagai SMRT Trains Limited pada 31 Disember 2001, supaya ia tidak dikaitkan dengan laluan MRT North East yang akan diuruskan oleh SBS Transit. Kecuali Laluan Utara Timur dan Laluan Pusat, SMRT Trains kini menguruskan kebanyakan perkhidmatan MRT Singapura.
SMRT Trains Limited ditubuhkan sebagai anak syarikat kereta api kepada syarikat induk SMRT Corporation, untuk mengawasi operasi kereta api yang dipindahkan daripada Mass Rapid Transit Corporation (MRTC) yang sebelum ini dimiliki oleh kerajaan.
Singapore MRT Limited ditubuhkan pada 6 Ogos 1987. Ia bekerjasama dengan MRTC, sebuah syarikat yang dikendalikan oleh kerajaan, sehingga tahun 1997. MRTC melancarkan seksyen MRT pertama Singapura pada 7 November 1987, dengan lima stesen dari Yio Chu Kang ke Toa Payoh. Operasi MRTC dipisahkan menjadi SMRT Corporation apabila ia bergabung dengan LTA pada 1 September 1995. Laluan ringan pertama kali memulakan operasi pada tahun 1998 dan dinamakan Singapore LRT Limited. Pada 31 Disember 2001, Singapore MRT Limited dan Singapore LRT Limited bergabung untuk menjadi nama semasa, SMRT Trains.
Armada kereta api SMRT kini terdiri daripada lima kereta api bergerak yang dibina pada dua laluan kereta api beratnya—Laluan Utara-Selatan dan Laluan Timur-Barat. Kereta api C151, C151A, C151B, C151C, dan R151 telah dinamakan mengikut perjanjian pembinaan yang berkaitan. Kereta api C651 dan C751B berhenti beroperasi dan telah ditamatkan sepenuhnya pada tahun 2024.Ia juga mengendalikan stok kereta api C830 dan C830C, yang beroperasi di Ring Road. SMRT Trains juga dibenarkan mengendalikan kereta api T251, yang beroperasi di Laluan Thomson-Pantai Timur. Kereta api C801, C801A, dan C801B di LRT Bukit Panjang dikendalikan oleh SMRT Light Rail. Selepas laluan CCL6 dibuka, C851E akan ditambah kepada armada SMRT.
Keretapi C751B, C151, dan C151A mempunyai skema warna hitam dengan jalur merah di tengah dan jalur kelabu di bahagian bawah. Sementara itu, jalur merah di bahagian bawah untuk kereta api C830 dan C830C. C651 adalah satu-satunya kereta api yang mempunyai skema warna dengan badan putih dan jalur merah di tengah. Satu-satunya kereta api dengan corak luar berwarna biru dan merah adalah C801. Sementara itu, C151B dan C801A adalah satu-satunya kereta api yang mempunyai livery piksel SMRT yang baru, yang terdiri daripada jalur putih, kuning, merah, dan hitam. Livery LTA yang baru, hitam dengan jalur hijau dan merah, terdapat pada kereta api C151C dan R151. Keretapi T251 mempunyai livery LTA yang baru—hitam dengan jalur sienna terbakar dan kuning.
Laluan LRT Bukit Panjang adalah satu-satunya laluan LRT yang dikendalikan oleh SMRT Light Rail. Laluan ini menghubungkan bandar-bandar Bukit Panjang dan Choa Chu Kang ke Laluan Downtown di Bukit Panjang, Laluan Utara-Selatan, dan Laluan Wilayah Jurong yang akan datang di Choa Chu Kang.