Agrāk 54. autobusu maršruts bija 3a. autobusu maršruts, bet kopš 2009. gada 1. janvāra to pārdēvēja par 54. autobusu maršrutu. 2010. gada 1. aprīlī maršruts tika pagarināts līdz Abrenes ielai.[1] No 2020. gada 1. februāra līdz 13. martam iekāpšana 54. maršruta autobusos notika tikai pa priekšējām durvīm. Pēdējoreiz šī kārtība atjaunināta 2023. gada 1. februārī.
No 2024. gada 1. oktobra maršruts vairs nekursē posmā no Abrenes ielas līdz Botāniskajam dārzam. Izmaiņas veiktas, lai palielinātu reisu skaitu un uzlabotu reisu izpildes prognozējamību. Tas tika iepriekš apspriests ar Voleru apkaimes iedzīvotājiem.[2]