Gimė 1833 m. kovo 22 d. Pakruojyje baltvokiečių šeimoje. Studijavo zoologiją Tartu universitete, priklausė vietos vokiečių studentų draugijai. Studijų metu daug keliavo tirdamas įvairius gyvūnus, buvo Kaukazo kalnuose, o 1858-1859 m. dalyvavo ekspedicijoje Chorasane. Pastarosios ekspedicijos metu aprašė gėlavandenės žuvies rūšį Squalius latus. Baigęs mokslus toliau keliavo po Prancūziją, Jungtinę Karalystę ir Alžyrą. Keliaudamas susipažino su būsima žmona Margharete, istoriko Wilhelm von Dönniges dukra. Susituokęs atsisakė planų vykti į ekspediciją JAV ir nusipirkęs žemės apsigyveno Žemutinėje Silezijoje. Labai domėjosi vorais, kuriuos tyrinėjo savo ekspedicijų metu bei vorus, kuriuos atsiųsdavo jo kolegos. E. Kaizerlingo vorų kolekciją sudarė apie 10,000 eksponatų, o po jo mirties šią kolekciją įsigijo Londono Gamtos istorijos muziejus. Mirė 1889 m. balandžio 4 d. Reichenbache.
Darbai
Er beendete Die Arachniden Australiens. (1871–1883) für Ludwig Carl Christian Koch.
Die Spinnen Amerikas (Herausgeber post mortem: George Marx). Bauer & Raspe, Nürnberg 1880–1893, 6 Teile in 4 Bänden.
