2016 m. Japonijos motociklų Grand Prix – 15-tasis 2016 m. MotoGP sezono etapas. Jis vyko 2016 m. spalio 16 d. Twin Ring Motegi trasoje, Montegyje. MotoGP klasėje avarijas patyrė abu Yamaha gamyklos lenktynininkai, todėl Marc Márquez tapo lenktynininkų čempionato nugalėtoju.
Ducati komandoje Héctor Barberá pakeitė traumą besigydantį Andrea Iannone. Barbera vietą Avintia Racing komandoje užpildė australų Superbike lenktynininkas Mike Jones.[1]
Dani Pedrosa per penktadienio treniruotę patyrė avariją per kurią susilaužė raktikaulį ir buvo pakeistas Hondos testuotoju Hiroshi Aoyama.[2]