2009–2010 m. Baltijos futbolo lyga – penktasis Baltijos futbolo lygos sezonas. Pirmenybės prasidėjo 2009 m. rugsėjo 22 d. ir baigėsi 2010 m. liepos 4 d.[1] Pirmenybės vyko atkrintamuoju principu, dalyvavo 16 komandų.
Pirmenybėse dalyvavo 6 Lietuvos, ir po 5 Latvijos ir Estijos komadas: