이번원(理藩院, 만주어: ᡨᡠᠯᡝᡵᡤᡳ ᡤᠣᠯᠣ ᠪᡝ ᡩᠠᡵᠠᠰᠠ ᠵᡠᡵᡤᠠᠨ Tulergi Golo-be Dasara Jurgan)은 청 제국에서 여러 번부에 관한 행정 사무 통할을 목적으로 설치된 관청이다.
숭덕제에 의해 내몽골이 평정된 뒤 그 간접통치를 목적으로 설치된 몽골아문(蒙古衙門, 만주어: ᠮᠣᠩᡤᠣ ᠵᡠᡵᡤᠠᠨ Monggo Jurgan, 만주어: ᠮᠣᠩᡤᠣ ᠶᠠᠮᡠᠨ Monggo Yamun)을 그 전신으로 한다. 1638년(숭덕 3년)에 이번원으로 개칭되었다. 초기 장관급으로 승정(承政), 차관급으로 좌참정(左参政)·우참정(右参政)이 설치되었는데, 1644년(순치 원년)에 승정을 상서(尚書), 참정을 시랑(侍郎)으로 각각 개칭하였다. 1659년(순치 16년)에는 예부 관할이 되었다가, 1661년(순치 18년)에 독립적 관청이 되었다.
청 제국의 판도가 외몽골, 청해, 서장, 신강으로 확대됨에 따라 이들 지역을 번부라고 칭하여 이번원에서 통할하게 된다. 이번원의 업무로는 여러 번부의 조공, 봉작, 봉록, 회맹, 교역, 재판 등이 있다. 1861년(함풍 10년)에 총리각국사무아문이 설치되기 이전에는 러시아와의 외교무역 관련 업무도 여기에서 맡았다.
1906년(광서 32년) 관제개혁으로 이번부(理藩部)라고 개칭되었다가, 1911년(선통 3년)에 내각제도가 창설되자 상서는 대신, 시랑은 부대신이 되었다.