제5공군(영어: Fifth Air Force)은 일본 요코타 비행장에 주둔하는 미국 태평양 공군의 서수공군이다.
현재 제5공군 사령관은 주일 미군 사령관을 겸직하고 있다.
1911년 1월 11일, 미국 육군은 필리핀 지부 공군(Philippine Department Air Force)를 필리핀 루손섬의 니콜스 비행장에서 창설했다. 당시 필리핀은 미국의 식민지였다. 1946년 7월 4일에 독립했다.
제2차 세계 대전 당시, 1차 필리핀 전역에서 제5공군은 처음으로 일본군과 교전했다.
6.25 전쟁에 참전했다. 백마고지 전투에서 제5공군은 745 소티 출격했다. 네이팜탄 358발을 포함해 폭탄 2700발을 백마고지에 투하했다.
1974년 11월 11일, 요코타 공군기지로 사령부를 이전했다.
2019년 4월 21일, 공군부는 요코타 비행장에 제5공군의 항공우주작전센터를 설치할 계획이라고 밝혔다.