ესტონეთის საპარლამენტო არჩევნები (1999) (ესტ.1999. aasta Riigikogu valimised) — საბჭოთა კავშირისგან დამოუკიდებლობის მოპოვების შემდეგ მესამე საპარლამენტო არჩევნები ესტონეთში. არჩევნები გაიმართა 1999 წლის 7 მარტს[1]. ამ არჩევნებზე ესტონეთის კოალიციურმა პარტიამ კატასტროფული შედეგი მიიღო, რომელმაც მხოლოდ 7 მანდატის მოპოვება შეძლო.