1942年初頭、ペギーは全米チャートで初のTOP10ヒットとなる「誰かが邪魔した」（Somebody Else Is Taking My Place）を発表。続けて翌1943年には「Why Don't You Do Right?」をリリース。この曲は100万枚以上の売り上げを記録し、彼女の名を知らしめた。1943年に放映された2つの映画『Stage Door Canteen』と『The Powers Girl』では、ペギーはグッドマンと共に歌っている。
1943年3月、ペギーはグッドマン楽団のギタリストであったデイヴ・バーバーと結婚する。その後2人は楽団を脱退。デイヴがスタジオで働き、ペギーは音楽活動を休止して娘ニキの養育に専念していた。しかし彼女は1944年には創設間もないキャピトル・レコード所属として作曲および収録に復帰した。このレーベルで彼女は数多くのヒット曲を発表した（多くはペギーとデイヴによる作詞・作曲）。例えば「アイ・ドント・ノウ・イナフ・アバウト・ユー」（I Don't Know Enough About You）や「イッツ・ア・グッド・デイ」（It's a Good Day, 1946年）などが挙げられる。1948年のレコード年間売り上げ1位となるスマッシュ・ヒットを記録した「マニャーナ」（Mañana）のリリースにより、彼女の「隠退生活」は完全に終わりを告げた。
ペギーは1951年にデイヴと離婚。1950年代前半に数年間キャピトル・レコードを離れるが、1957年に復帰する。彼女は、リトル・ウィリー・ジョンのヒットソング「フィーバー」（Fever）や、ジェリー・リーバー&マイク・ストーラーの「イズ・ザット・オール・ゼア・イズ」（Is That All There Is?）のカバー・バージョンが最もよく知られている。彼女のキャピトル・レコードレーベルとの関係はほぼ30年間に及んだ。一方、デッカ・レコードと契約していた期間は短い（1952年 - 1956年）ものの、この間に最も評判の高かったアルバム『ブラック・コーヒー』（Black Coffee, 1956年）をリリースするなど、それは芸術的に豊かな時期であった。デッカ・レコードとの契約中に、ペギーは「ラヴァー」（Lover）や「ミスター・ワンダフル」（Mr. Wonderful）などのヒットソングをリリースした。
