オランダに戻った後、哺乳動物に関する著書『哺乳類-現行哺乳類と化石哺乳類の系統学と解剖学の概要』(Die Säugetiere. Einführung in die Anatomie und Systematik der recenten und fossilen Mammalia) を出版した。その他に著書としては『高等教育のための生物学教科書』(Lehrbuch der Biologie für Hochschulen, 1911年)、『インドからオーストラリア間の列島の魚類』(The Fishes of the Indo-Australian archipelago, 1911年 - 1936年)7巻がある。
1877: Die Nebenorgane des Auges der einheimischen Lacertidae. Inaugural-dissertation zur Erlangung der Doctorwürde bei der medicinischen Fakultät der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität zu Bonn eingereicht und mit den beigefügten Thesen vertheidigt am 6. August 1877
1886: Studien über Säugethiere. Ein Beitrag zur Frage nach dem Ursprung der Cetaceen
1890: Ethnographische Notizen über Flores und Celebes, Supplement zu Band III von "Internationales Archiv für Ethnographie". P. W. M. Trap, Leiden.
1890 - 1907: Zoologische Ergebnisse einer Reise in Niederländisch Ost-Indien, Teil 1 (1890-1891), Teil 2 (1892), Teil 3 (1894), Teil 4 (1897-1907). E. J. Brill, Leiden.
1902: Introduction et description de l'expédition. Siboga Expeditie
1904: Die Säugetiere. Einführung in die Anatomie und Systematik der recenten und fossilen Mammalia
1913: Die Fische der Siboga-Expedition. Siboga Expeditie
1927 - 1928: Die Säugetiere. Einführung in die Anatomie und Systematik der recenten und fossilen Mammalia (2. Auflage). Anatomischer Teil unter Mitwirkung von H. M. de Burlet (1928). Systematischer Teil unter Mitwirkung von O. Abel.
1936: Primaty. Anatomiya, sistematika i paleontologiya lemurov, dolgopyatov i obez'yan. Perevod, redaktsiya i dopolneniya M. F. Nesturkh
D'Arcy Wentworth Thompson: Max Wilhelm Carl Weber. 1852-1937. Obituary Notices of Fellows of the Royal Society, Vol. 2, No. 6 (Jan., 1938), S. 347 - 355