Tennista specializzato nel doppio, in questa specialità ha raggiunto ben sei finali nei tornei del Grande Slam, tre agli US Open, due a Wimbledon e una al Roland Garros. Di queste perde solo gli US Open 1987 e 1989.
La prima finale la raggiunge agli US Open 1985 insieme al connazionale Ken Flach ed hanno la meglio sul team francese formato da Henri Leconte e Yannick Noah per 6(5)–7, 7–6(1), 7–6(6), 6–0.
Nel 1987 gioca la sua unica finale a Parigi, insieme a Anders Järryd supera un altro team francese, questa volta formato da Noah e Guy Forget. Nello stesso anno arriva la prima finale a Wimbledon dove, assieme a Ken Flach, superano gli spagnoli Sergio Casal e Emilio Sánchez Vicario in cinque set. Pochi mesi dopo agli US Open perde la prima finale dello Slam, per mano di Stefan Edberg e Anders Järryd.
A Wimbledon 1988 riescono a difendere il titolo dell'anno precedente sconfiggendo in finale John Fitzgerald e Anders Järryd, nella stessa stagione la coppia Flach-Seguso partecipa alle Olimpiadi di Seul. Raggiungono la finale dove superano la coppia spagnola e testa di serie numero due formata da Sergio Casal ed Emilio Sánchez in un match conclusosi solo al quinto set per 9-7, riuscendo così a conquistare la medaglia d'oro.
Nel 1989 arrivano in finale agli US Open ma vengono sconfitti da John McEnroe e Mark Woodforde.
Chiude la carriera con ventidue titoli vinti nel doppio e la testa della classifica raggiunta per la prima volta nel settembre 1985 e mantenuta in totale per cinquanta settimane.[1]
Nel 1987 si è sposato con la tennista canadese Carling Bassett[2] ed insieme hanno giocato qualche torneo di doppio misto senza però riuscire a vincere alcun titolo. La coppia ha avuto quattro figli,
tutti maschi.