Si laurea nel 1960 alla Harvard University, frequenta poi l'università di Oxford (dove studia, tra gli altri, anche con Richard Cobb) grazie a una borsa di studio Rhodes (Rhodes Scholarship) e completa il dottorato in storia nel 1964.
Lavora al New York Times dal 1964 al 1965, occupandosi di cronaca nera (forse è anche per questa esperienza che i suoi libri risultano di più scorrevole lettura rispetto a quelli di altri storici).
Arriva alla facoltà di storia dell'università di Princeton nel 1968 ed ha la cattedra di Storia Europea alla fondazione Shelby Cullom Davis.
Il 1º luglio 2007 diventa professore emerito a Princeton; viene nominato Carl H. Pforzheimer University Professor a Harvard e direttore della Biblioteca Universitaria di Harvard[1].
Darnton è un pioniere nell'area sempre più sviluppata della storia del libro.
Uno dei suoi libri, The Forbidden Best-Sellers of Pre-Revolutionary France (New York, 1996), ha vinto il premio National Book Critics Circle Award per la critica nel 1995.
Nel 1999 viene proclamato Cavaliere della Legion d'Onore, la più alta onorificenza concessa dalla nazione francese, a riconoscimento per il suo lavoro.
Nel 2004 gli è assegnato il premio Gutenberg dalla International Gutenberg Society.
Nel 2005 riceve un riconoscimento per i suoi studi dalla American Printing History Association (Associazione Americana della Storia dell'Editoria)[2].
Il mesmerismo e il tramonto dei Lumi (Mesmerism and the End of the Enlightenment in France, 1968), traduzione di Roberto Carretta e Renato Viola, Milano, Medusa, 2005.
Il grande affare dei Lumi. Storia editoriale dell'«Encyclopedie» 1775-1800 (The Business of Enlightenment: A Publishing History of the Encyclopédie, 1775-1800; 1979), traduzione di Antonio Serra, Milano, Sylvestre Bonnard, 1998. - Adelphi, Milano, 2012.
L'intellettuale clandestino. Il mondo dei libri nella Francia dell'Illuminismo (The Literary Underground od the Old Regime, 1982), traduzione di Giovanna Ferrara degli Uberti, Collana Saggi blu, Milano, Garzanti, 1990, ISBN978-88-115-9826-8.
Il grande massacro dei gatti e altri episodi della storia culturale francese (The Great Cat Massacre and Other Episodes in French Cultural History, 1984), a cura di Renato Pasta, Collana Saggi n.40, Milano, Adelphi, 1988, ISBN978-88-459-0312-0.
Il bacio di Lamourette (The Kiss of Lamourette: Reflections in Cultural History, 1989), traduzione di Luca Aldomoreschi, Milano, Adelphi, 1994.
George Washington's False Teeth: An Unconventional Guide to the Eighteenth Century, 2003
La dentiera di Washington. Considerazioni critiche a proposito di illuminismo e modernità, Introduzione di Eugenio Lecaldano, trad. di Andrea Branchi, Donzelli, Roma, 1997.
L'età dell'informazione. Una guida non convenzionale al Settecento, traduzione di Franco Salvatorelli, Milano, Adelphi, 2007.
Il futuro del libro (The Case for Books: Past, Present, and Future, 2009), traduzione di Adriana Bottini, Milano, Adelphi, 2011.
(EN) The Devil in the Holy Water, or the Art of Slander from Louis XIV to Napoleon, Philadelphia, PA, University of Pennsylvania Press, 2009.
I censori all'opera (Censors at Work: How States Shaped Literature, 2014), traduzione di Adriana Bottini, Collana L'oceano delle storie, Milano, Adelphi, 2017, ISBN978-88-459-3202-1.
Un tour de France letterario (A Literary Tour de France: The World of Books on the Eve of the French Revolution, 2018), Collana Frecce, Roma, Carocci, 2019, ISBN978-88-430-9638-1.
Editori e pirati (Pirating and Publishing: The Book Trade in the Age of Enlightenment, 2021), traduzione di Svevo D'Onofrio, Milano, Adelphi, 2023, ISBN978-88-459-3780-4.
The Revolutionary Temper: Paris, 1748-1789, New York, W. W. Norton, 2023, ISBN978-1-32-403558-9.