Dopo aver terminato gli studi, MacMillan è tornato in Scozia come compositore associato presso la Scottish Chamber Orchestra.
MacMillan aveva raggiunto la notorietà con la prima esecuzione orchestrale del suo lavoro The Confession of Isobel Gowdie nel 1990 da parte della BBC Scottish Symphony Orchestra ad un festival di musica classica. In seguito ha ottenuto diverse importanti commissioni come compositore. Veni, Veni, Emmanuel, concerto per percussioni e una delle sue opere più eseguite, ha debuttato nel 1992.
Opere
Compositore di fama internazionale, la sua fede cattolica lo ha portato a diventare punto di riferimento nel campo della musica sacra contemporanea. Ha composto, tra l'altro, vari brani per la visita di papa Benedetto XVI in Gran Bretagna, avvenuta nel settembre 2010.
Tra le sue composizioni più importanti si segnalano: