Micyllus nacque con il come Jakob Moltzer a Strasburgo. Dal 1518 al 1522 studiò a Erfurt, poi alla fine del 1522 andò dall'insegnante Filippo Melantone a Wittenberg. Dal 1524, all'età di ventanni, diresse la scuola latina di Francoforte, su raccomandazione di Melantone. Ma non si trovò a suo agio con la riforma protestante diffusasi a Francoforte dal 1526, e successivamente trovò un posto come professore a Heidelberg, nel gennaio 1533.
Opere principali
Varia epigrammata graeca & latina & alia carmina graca, Basel 1538;
Sylva variorum carminum;
Commentataria in Homerum, Basel 1541;
Annotationes in Joh. Bocatii genealogiam Deorum, Basel 1532;
Scholia ad Martialis obscuriores aliquot locos;
Ratio examinandorum versuum;
Calendarium;
Carmen elegiacum de ruina arcis Heidelbergensis, quae facta est 1537;
Annotationes in Ovidium, & in Lucanum;
Arithmetica logistica;
Euripidis vita, Basel 1558;
De Tragaedia & ejus partibus;
Traductio aliquot operum Luciani cum scholiis;
Annotationes in Euripidem, Basel 1562;
Urbis Francofurdi gratulatio ad Caronum, Leipzig 1530;
Bibliografia
Classen, Johannes. Jakob Micyllus, Rektor zu Frankfurt am Main 1524-1533 und 1537-1547, als Schulmann, Dichter und Gelehrter. Frankfurt am Main 1861
Gerhard Dolinsky. Aus der Geschichtes des Frankfurter Gymnasiums, in: H.-J. Heydorn und K. Ringshausen: Jenseits von Resignation und Illusion - Festschrift zum 450jährigen Bestehen des Lessing-Gymnasiums. Frankfurt am Main 1971
Johann Classen. Nachträge zu der Biographie des Jakob Micyllus, Frankfurt/M 1861
Georg Ellinger. Jakob Micyllus und Joachim Camerarius. In: Neue Jahrbuch für das klass. Altertum, Geschichte und deutsche Literatur und für Pädagogik Jahrgang 24 (1909), pp. 1 50-173. - Ellinger 2, pp. 28–44
Otto Clemen. Zu Jakob Micyllus In: Neue Heidelberger Jahrbuch N. F. (1941): 1-11
Arthur Henkel. "In Mortem Simii Heidelbergensis". Zu einem Epikediom des Jakob Micyllus In: Festschrift Leonard Forster. Baden-Baden 1982, S. 264-280
Walther Killy, ed. Literaturlexikon: Autoren und Werke deutscher Sprache (15 Bände). Gütersloh, München: Bertelsmann-Lexikon-Verl., 1988-1991 (CD-ROM: Berlin 1998, ISBN 3-932544-13-7)