Il Gran Premio motociclistico del Giappone 2000 corso il 9 aprile, è stato il terzo Gran Premio della stagione 2000 e ha visto vincere nella classe 500 la Yamaha di Norick Abe, nella classe 250 la Honda di Daijirō Katō e nella classe 125 la Derbi di Yōichi Ui.
Nella classe 125 si tratta del ritorno alla vittoria della Derbi dopo 11 anni e contemporaneamente della prima vittoria del pilota giapponese Yōichi Ui nel motomondiale. Nel Gran Premio di casa i piloti giapponesi occupano 8 dei 9 posti sul podio, l'unico che riesce ad inserirsi è Kenny Roberts Jr che si aggiudica il secondo posto della classe 500.
Classe 500
Arrivati al traguardo
Ritirati
Classe 250
Arrivati al traguardo
Ritirati
Squalificato
Non partiti
Classe 125
Arrivati al traguardo
Ritirati
Non qualificato
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