Emanuel Philibert von Waldstein-Wartenberg, nato Emanuel Philibert von Waldstein (Vienna, 2 febbraio 1731 – Trebitsch, 22 maggio 1775), è stato un nobile austriaco.
Figlio del conte Joseph von Waldstein e di sua moglie, Maria Josepha von Trauttmansdorff-Weinsberg, Emanuel Philibert sposò la principessa Maria Anna Teresa del Liechtenstein il 21 maggio 1754, alla quale fece come regalo di nozze alla casa di caccia Lichtenwald vicino a Fleyh. Dopo che i conti di Wartenberg si estinsero, i conti di Waldstein ottennero nel 1758 il permesso di assumerne il cognome e lo stemma, oltre a tutti i beni.
Nel feudo ereditato di Dux, decise di costruire una fabbrica calzaturiera ed una miniera di carbone dati i ricchi giacimenti di cui disponeva l'area. Nel 1775 fondò un orfanotrofio nella fabbrica di tessuti di Ober-Leitensdorf.
Dopo la sua morte, venne succeduto dal primogenito Joseph Karl Emanuel.
Nel 1754 si sposò in prime nozze con la principessa Maria Anna Teresa del Liechtenstein, figlia del principe Emanuele e di sua figlia, Maria Anna Antonia di Dietrichstein-Weichselstädt, dalla quale ebbe i seguenti eredi: