Tra le sue maggiori opere si ricordano il romanzo incompiuto Arminius e le tragedie Ibrahim Bassa (1650), Cleopatra (1661), Agrippina ed Epicharis (1665), Sophonisbe (1669) e Ibrahim Sultan (1673).
Esponente del teatrobarocco, Lohenstein portò sulle scene vicende passionali descritte in modo turgido e sentenzioso.
Le tematiche principali delle sue opere furono la vanità terrena, la morte, la corruzione delle corti, l'ambizione dei politici, il fato ineluttabile.