Il territorio è prevalentemente collinare nell'area sud-orientale e meridionale per poi digradare progressivamente verso occidente e verso nord. In prossimità del confine meridionale è situata la Gibson Hill che raggiunge i 474 metri di altezza ed il lago Edinboro. Nell'area orientale scorre il French Creek che alimenta il lago della
Union City Reservoir. Diversi fiumi sfociano direttamente nel lago Erie dopo un breve corso. Tra questi il principale è l'Elk Creek che nasce nell'area centrale e scorrendo prevalentemente verso ovest sfocia nel lago Erie in prossimità di Lake City. Nella parte occidentale scorre il Conneaut Creek e in quella meridionale ha origine il Cusewago Creek che scorre verso sud.
Il capoluogo di contea e la città più popolosa è Erie situata sul lago omonimo.
In prossimità di Erie si protende nel lago Erie la penisola sabbiosa di Presque Isle.
I primi abitanti del territorio contea furono gli indianiEriez che vennero in seguito soppiantati dagli irochesi.
I primi europei a insediarsi nella regione furono i francesi che nel 1753 costruirono il forte Presque Isle sull'omonima penisola.
Il forte fu conquistato dagli inglesi nel 1763 nel corso della guerra dei sette anni. Parte del territorio dell'attuale contea faceva parte del cosiddetto Erie Triangle un territorio rivendicato dagli stati confinanti di New York e della Pennsylvania e dagli Stati del Connecticut e Massachusetts. Il territorio passò alla fine alla Pennsylvania nel 1792 e la città di Erie venne fondata 3 anni dopo.
La contea fu istituita nel 1800.