Dal 1790 al 1796 Mrongovius insegnò il polacco e il greco al Collegium Fridericianum dell'università. Nel 1796 sposò Wilhelmina Luise Paarmann. Fino al 1798 fu anche caporedattore di varie case editrici di lingua polacca in Prussia. Nel 1798 ricevette il pastorato alla Chiesa di Sant'Anna a Danzica, dove inoltre insegnò il polacco dal 1812 al 1817. Oltre a polacco, greco e casciubo, insegnò anche in ceco e russo. Morì all'età di 91 anni il 3 giugno 1855 a Danzica (Gdańsk).
In onore di Mrongovius, il nome della vecchia città di Sensburg nella Prussia Orientale (Żądzbork in polacco) fu cambiato in Mrągowo nel 1947 dalla nuova amministrazione polacca.
Mrongovius è inoltre ricordato per essere la fonte primaria di sette serie di note sulle lezioni di Immanuel Kant in antropologia, metafisica, teologia, fisica, logica, e due sulla filosofia morale. Mrongovius fu autore di svariati libri e di uno dei primi dizionarii polacco-tedeschi. La sua grande mole di produzione letteraria, consistente di oltre 1000 pezzi, includendo molti manoscritti, è tuttora conservata alla biblioteca della Accademia Polacca delle Scienze a Danzica.
Dizionarii polacco-tedeschi
1794 Marienwerder Königl. Westpreuß. Kanterschen Hofbuchdruckerey. Christoph Coelestin Mrongovius Handwörterbuch der Hochpolnischen Mundart — Nowy Slownik Polsko-niemiecki.
1835 Königsberg in Preussen: Gebrüder Bornträger, Ausführliches polnisch-deutsches Wörterbuch — kritisch bearbeitet von Christoph Cölestin Mrongovius