Francesco Maria Della Rovere (Genova, 1695-1768), ultimo discendente del ramo ligure della nobile famiglia, ne ordinò il rifacimento tra il 1762 e il 1764. L'interno venne ricoperto di stucchi e pitture dal Brusco e dal Tagliafichi. Rimase inalterato solo il sepolcro dei genitori di Papa Sisto IV scolpito tra il 1482 e il 1483 dai fratelli D'Aria.
Recentemente, la cappella è stata restaurata, ed è utilizzata per concerti o tavole rotonde.
L'interno della cappella è a navata unica rettangolare con volta a vela ed abside a pianta quadrata coperta da una cupola che presenta solo esternamente un tamburo. Originariamente, la chiesa era interamente decorata da affreschi realizzati dal Mazone nel 1489. Di tali affreschi rimangono poche tracce visibili dietro l'altare e sul tamburo della cupola. Attualmente, invece, è in stile rococò, con ricche stuccature e affreschi dai colori vivaci.
Lo strumento è racchiuso entro una cassa lignea riccamente decorata e chiusa da portelle dipinte. La mostra è composta da tre cuspidi di canne di principale, ciascuna in campo proprio e composta da 9 canne. La trasmissione è integralmente meccanica sospesa e la consolle è a finestra, con un'unica tastiera di 45 note con prima ottava scavezza e pedaliera a leggioscavezza di 9 note priva di registri propri e costantemente unita al manuale.
Bibliografia
Giorgio Rossini, La Cappella Sistina di Savona. Architettura francescana e mecenatismo roveresco, Savona, Marco Sabatelli Editore, 2000.
Giovanna Rotondi Terminiello, 1762-1764: un "moderno costume" per la Cappella Sistina, in Un'isola di devozione a Savona. Il complesso monumentale della Cattedrale dell'Assunta, a cura di Giovanna Rotondi Terminiello, Savona, Marco Sabatelli Editore, 2002, pp. 295–313.
Francesco Maria Della Rovere mecenate della musica: gli organi di Filippo e Felice Piccaluga della Cappella Sistina e della Cattedrale di Savona (1762-67). La storia - Il restauro, a cura di Maurizio Tarrini, Genova-Savona, Associazione Ligure per la Ricerca delle Fonti Musicali, 2009 (Studi e fonti per la storia della musica in Liguria, 8). ISBN 88-85429-08-4
Maurizio Tarrini, L'orgue Piccaluga 1764 de la chapelle Sixtine de Savone, in «L'Orgue Francophone», n. 41 (2010), pp. 75–84.
Discografia
L'organo Piccaluga 1764 della Cappella Sistina di Savona, Davide Merello organo (CD allegato alla pubblicazione edita in occasione del restauro, cfr. Bibliografia: Francesco Maria Della Rovere mecenate della musica 2009).