La cronometro femminile Junior dei Campionati europei di ciclismo su strada 2013 si è svolta il 19 luglio 2013 nei dintorni di Olomouc, nella Repubblica Ceca, su un percorso totale di 13,2 km. La medaglia d'oro è stata vinta dalla francese Séverine Eraud con il tempo di 20'48"33 alla media di 38,07 km/h, argento all'olandese Floortje Mackaij e a completare il podio l'ucraina Olena Demidova.
Partenza per 39 cicliste, tutte giunte al traguardo.